La macchina può essere utilizzata anche come pompa di rarefazione; basta per ciò collegare il recipiente, in cui si vuole rarefare l'aria o un altro gas contenuto, con il tubicino di aspirazione e lasciare libero l'altro.
In questo caso c'è un limite alla pressione minima ottenibile, che si raggiunge quando il gas aspirato dalla pompa, e successivamente compresso fino ad occupare il solo spazio nocivo, non riesce più ad azionare la valvola di uscita.